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杀菌灭藻剂的用途比较广泛，常在工业循环冷却水系统中、游水池内等地进行迅速杀菌灭藻，具有杀菌能力强、抑制病菌藻类时间快等特点。也可以用在做粘泥剥离剂使用。但其实杀菌灭藻剂在具体的用法用量上，有以下几点是需要注意的。

一般杀菌灭藻剂也可用来做粘泥剥离剂，需求时可投加适当有机硅类消泡剂。也可以与其他杀菌剂合作使用，例如异唑啉酮、、二硫基等，可起到增效作用。

需要注意的是，不要将杀菌灭藻剂与氯酚类药剂共同使用。也不要与阴离子表面活性剂如聚、水解聚马等混用。投加杀菌灭藻剂后循环水中因剥离而呈现污物，应及时滤除或捞出，避免泡沫不见后堆积。

杀菌灭藻剂也可分为农业杀菌剂和工业杀菌剂两种;

农业杀菌剂是用于防治由各种病原微生物引起的植物病害的一类，一般指杀真菌剂。但国际上，通常是作为防治各类病原微生物的药剂的总称。随着杀菌剂的发展，又区分出杀细菌剂、杀病毒剂、杀藻剂等亚类。

工业杀菌剂按照杀菌机理可分为氧化性杀菌剂和非氧化性杀菌剂两大类。氧化性杀菌剂通常为强氧化剂，主要通过与细菌体内代谢酶发生氧化作用而达到杀菌目的。常用氧化性杀菌剂有、二氧化氯、、臭氧、等。非氧化性杀菌剂是以致毒剂的方式作用于微生物的特殊部位，从而破坏微生物的细胞或者生命体而达到杀菌效果，常见非氧化性杀菌剂有氯酚类、异唑啉酮、季铵盐类等。

氧化性杀菌灭藻剂优点：

氧化性杀菌灭藻剂具有杀菌灭藻速度快、杀菌效果的广谱性高、处理费用低、对环境污染相对影响较小、微生物不易产生抗药性等优点，使用方便，杀菌效果好，可以和许多水处理药剂一起使用而不影响其作用。

氧化性杀菌灭藻剂缺点：

受到水中的有机物和具有还原性物质的影响较大，药剂时间短，受水中的PH值影响也较大，同时，分散渗透和剥离效果差等。